Een nieuw instrument voor microbioom-gastheerprofilering voor gezondheid en ziekte.
TenWise BV en Predica Diagnostics BV hebben financiële steun ontvangen van het Nederlandse RVO(MIT-R&D-samenwerkingsproject) voor de gezamenlijke ontwikkeling van het high-throughput MicroBioDX-platform voor de karakterisering van microbioom-gastheer interacties en hun rol in de ontwikkeling en behandeling van inflammatoire darmziekten en kanker.
Vergeleken met bestaande, geavanceerde sequentiegebaseerde technologieën is het MicroBioDX-platform kosteneffectiever, sneller en veelzijdiger: het brengt de interacties tussen gastheer en microbioom in kaart door kwantitatieve informatie te leveren over de expressieniveaus van honderden interessante menselijke genen, en detecteert tegelijkertijd pathogene bacteriën, schimmels en virussen die deel uitmaken van een ziek darmmicrobioom.
MicroBioDx maakt gebruik van ciRNAseq, Predica's baanbrekende, high throughput targeted RNA sequencing technologie in combinatie met TenWise's expertise op het gebied van literature mining, kunstmatige intelligentie en algoritme-ontwikkeling, om biologische routes te detecteren die geassocieerd zijn met gezondheid en ziekte. Deze combinatie zal onderzoekers en artsen helpen om de prognose van patiënten beter te voorspellen en de behandeling te sturen met precisiemedicijnen. MicroBioDx zal ook de kosten van analyses voor grote datasets verlagen en de doorlooptijd verkorten van weken tot dagen. Het zal daarom zeer relevant zijn voor de evaluatie van resultaten van grote klinische onderzoeken en van individuele patiënten voor wie een snelle diagnose essentieel is.
"TenWise werkt samen met Predica omdat ciRNAseq het mogelijk maakt om zowel DNA/RNA van de menselijke gastheer als het microbioom van één en hetzelfde menselijke monster te meten. Dit betekent dat menselijke genexpressiedata en microbioomdata sneller worden gegenereerd en dat interacties tussen het microbioom en de gastheer nauwkeuriger worden bepaald. Binnen dit project biedt Predica ook toegang tot grote datasets die we zullen gebruiken om onze voorspellingen op basis van text mining te valideren", aldus Dr. Wynand Alkema, CSO van TenWise.
"Predica verwelkomt TenWise als partner met expertise die zeer complementair is aan die van Predica", zegt Dr. William Leenders, CSO van Predica Diagnostics. "Als expert op het gebied van text mining en machine learning zal TenWise kenniskaarten ontwerpen van biologische routes die relevante micro-organismen koppelen aan de expressie van menselijke genen die deel uitmaken van de gastheerrespons bij gezondheid en ziekte. Deze kenniskaarten zijn essentiële elementen van de data-interpretatiesoftware die we zullen ontwikkelen voor onderzoekers en voor artsen die zullen worden ondersteund bij een snelle en accurate behandeling van hun patiënten."
Predica Diagnostics B.V is een spinoff van het Radboudumc, actief op het gebied van diagnostiek, prognostiek en voorspelling van behandelrespons in de oncologie. Predica Diagnostics streeft ernaar om haar ciRNAseq technologie binnen 1 tot 2 jaar naar patiënten te brengen met een eerste focus op de ontwikkeling van de CervicaDX test. Deze test maakt niet-invasieve detectie mogelijk van afwijkingen in de baarmoederhals bij vrouwen die risico lopen op het ontwikkelen van baarmoederhalskanker, met een ongekende specificiteit. Deze en andere diagnostische tests voor gastheer-microbioom-interacties zullen de diagnose en prognosevoorspelling verbeteren en een lijst van mogelijk succesvolle precisiegeneesmiddelen opleveren, wat zal helpen bij de ontwikkeling van gepersonaliseerde behandelplannen voor kankerpatiënten.
TenWise B.V. biedt text mining-oplossingen die onderzoekers en medische professionals helpen om op een snelle en effectieve manier kennis uit literatuur te halen. Ook werkt het binnen consortia van industrie en academische wereld in de biowetenschappen aan kunstmatige intelligentie-oplossingen die helpen bij het ontdekken van geneesmiddelen met een speciale focus op interventies in het microbioom. Het bedrijf is gevestigd op het Leiden Bio Science Park in Nederland en werkt voor klanten over de hele wereld.
